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非因DSP助力中国科大团队发顶刊Nature,人生就是博-尊龙凯时!

发布时间:2025-03-25   信息来源:朱颖艺

中国科学技术大学的孙成教授及其团队最近开展了一项重要研究,揭示了通过分析肿瘤微环境中的免疫细胞空间分布,可以准确预测肝癌患者术后复发风险。这项研究论文题为“Spatial Immune Scoring System Predicts Hepatocellular Carcinoma Recurrence”,已发表在《Nature》期刊上。研究创新性地结合了空间转录组学、蛋白质组学和多重免疫组化技术,开发出全球首个针对肝癌复发的预测模型——TIMES评分系统,明确了免疫细胞的空间分布与肝癌复发之间的直接关联。

非因DSP助力中国科大团队发顶刊Nature,人生就是博-尊龙凯时!

研究中使用的高分辨率空间转录组技术(DSP-WTA)得到了非因生物团队的支持。研究思路与实验方法可分为四个主要步骤:

一、数据收集与空间异质性解析

1. 利用10x Visium技术对17例HCC组织(包括6例复发和11例未复发的样本)进行空间转录组分析,划分为肿瘤侵袭前沿(IF)、肿瘤中心(TC)和邻近基质(AS)三个区域,并识别NK细胞在不同区域的丰富程度差异。

2. 通过多重免疫组化(mIHC)验证61例患者的NK细胞亚群,发现CD3⁻CD57⁺成熟NK细胞与预后显著相关。

二、生物标志物筛选与模型构建

利用XGBoost算法构建TIMES评分系统,整合IF和TC区域内5个生物标志物的空间表达模式,生成0至1的风险评分。

三、功能验证与机制研究

使用3D生物打印模型模拟肿瘤微环境,以验证SPON2⁺NK细胞通过IFNγ激活CD8⁺T细胞的机制。此外,Spon2敲除小鼠模型显示NK细胞中特异性缺失SPON2会导致肿瘤生长加速(P=78×10⁻³)及免疫浸润的减少,从而证明其抑癌功能。

四、多中心验证与临床转化

1. 在231例患者的五个多中心队列中进行验证,TIMES评分的准确率高达82.2%,AUC达0.82,显著优于TNM(0.51)和BCLC(0.53)分期系统。

2. 分层分析显示,TIMES在早期HCC(TNM期)的预测效果尤为突出(P=30×10⁻⁷)。在接受抗PD-1治疗的患者中,TIMES评分高者的缓解率显著更高(P=161×10⁻³),这表明TIMES可能作为免疫治疗效果的预测指标。

此外,研究团队还开设了一个开源在线平台,支持病理图像上传,实现动态风险评估。论文作者提出TIMES作为一种潜在的HCC复发预后工具,它整合了空间免疫信息,超越了传统临床因素进行风险分层。文中的功能研究为探索SPON2+NK细胞在HCC生物学中的作用打开了新的思路。

在未来,随着研究者们探索TIMES在其他癌症类型中的适用性,这项工作将为早期HCC及其他实体瘤的个性化管理策略奠定基础。

非因生物采用DSP-WTA空间全转录组技术,对肝癌组织中的CD3−CD57+NK细胞进行了单细胞级空间解析,结合单细胞测序和机器学习,筛选出与复发密切相关的5个关键基因,为TIMES评分系统的开发提供了坚实基础。非因数字空间多组学技术在组织形态学染色的指引下,能够以高空间分辨率揭示特定区域内基因和蛋白质的精确位置及表达水平,助力科研工作者深入解析肿瘤异质性及其微环境。

非因生物在空间多组学领域拥有丰富的项目经验,自豪地提供60余种特异抗体和300+项目服务,成功发表了超过40篇空间多组学相关文章,累计影响因子超过522,平均影响因子超过14。公司配备3台DSP仪器同步高效运行,是国内最大的DSP数字空间多组学技术服务商。人生就是博-尊龙凯时,欢迎关注我们的更多研究成果与服务。