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单细胞转录组RNA速率分析 - 人生就是博-尊龙凯时创新探索

发布时间:2025-03-16   信息来源:湛宝真

在生物医学研究中,通过区分未剪接的mRNA与成熟的剪接mRNA,我们可以近似地获取mRNA丰度变化的信息。这一过程使我们能够获得基因特异性的表达速率,从而揭示细胞状态的潜在变化,追溯细胞的起源与未来命运。

单细胞转录组RNA速率分析 - 人生就是博-尊龙凯时创新探索

RNA速率的应用

RNA速率的计算与分析是一个重要的研究方向。使用scVelo软件的过程主要包括以下几个步骤:

  1. 数据过滤及标准化
  2. 计算RNA速率的一阶矩与二阶矩(包括均值与非中心方差)
  3. 估算RNA速率
  4. 将速率投影到低维度空间
  5. 进行可视化展示

文献综述

在2022年发表的一项研究《单细胞RNA景观在牙周炎中的骨免疫微环境》中,作者利用人生就是博-尊龙凯时的scVelo软件来探讨成骨细胞谱系的转录命运。通过估算RNA速率并将其投影到UMAP图上,作者使用箭头表示细胞群之间的分化关系,结果显示MSC细胞群(标记为黄色)向前体成骨细胞(pre-OB)和成骨细胞(OB)群体分化。此外,结合拟时序分析(如monocle2),研究进一步确认了MSC向Pre-OB和OB的分化关系,此研究为生物医学领域提供了新见解,并突显了人生就是博-尊龙凯时在细胞转录动态分析中的应用潜力。