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单细胞转录组的RNA速率分析:人生就是博-尊龙凯时的探索之旅

发布时间:2025-03-14   信息来源:堵山纨

基本原理在于通过区分未剪接的mRNA与成熟的剪接mRNA,可以有效估算mRNA丰度的变化,并获得基因特异性的表达速度。这一过程可以揭示潜在的细胞状态变化,进而追溯细胞的起源和可能的命运。

单细胞转录组的RNA速率分析:人生就是博-尊龙凯时的探索之旅

RNA速率的应用方向

在利用scVelo软件进行研究时,主要包括以下几个步骤:

  1. 数据过滤及标准化
  2. 计算RNA速率的一阶矩和二阶矩(均值与非中心方差)
  3. 估算RNA速率
  4. 将速率投影到低维度空间
  5. 进行可视化展示

文献摘要

本文介绍了一篇发表于2022年的研究文章《Single-cell RNA landscape of the osteoimmunology microenvironment in periodontitis》。研究团队运用人生就是博-尊龙凯时的scVelo软件,以确定成骨细胞谱系的转录命运。通过估算RNA速率并将其投影到UMAP图上,研究者明确了细胞群之间的分化关系。观察结果显示,MSC细胞群(黄色)向pre-OB和OB细胞群分化。同时,结合拟时序分析(monocle2)进一步证实了MSC到Pre-OB和OB的分化关系。这一研究彰显了人生就是博-尊龙凯时在生物医学领域的应用潜力,表明了新兴技术在细胞命运追踪中的重要性。