细胞的能量代谢是影响细胞表型的核心因素,直接关系到细胞的命运和功能。在细胞的发育周期、环境压力或治疗干预后,其可能会经历代谢重编程。因此,在重大疾病研究,特别是癌症中,应用安捷伦Seahorse XF代谢分析技术进行线粒体呼吸(OCR)和糖酵解(ECAR)的测量显得至关重要,这不仅能揭示疾病表型背后的细胞能量机制,还能够促进对治疗策略的深层理解。
数据归一化(标准化)在生物学实验中发挥着不可或缺的角色。它不仅能校正实验误差,提高数据间的可比性,还有助于优化后续的数据分析过程,为进一步的生物学研究建立可靠的基础。因此,在进行生物实验时,重视归一化步骤并选择合适的方法,以确保数据的准确性和可靠性是极其重要的。
在进行Seahorse XF代谢分析时,诸如细胞增殖速率、细胞分化程度和黏附效率等因素,都会影响实验中实际监测到的细胞密度及其在孔板中的均匀性,这最终可能影响数据的准确性。因此,数据的归一化成为了Seahorse XF原始数据呈现和后续分析的重要环节,其能有效校正不同孔中细胞数量的差异,从而确保实时细胞代谢测量的准确性。
为了解决细胞能量代谢的数据归一化,存在多种方法,例如总蛋白归一化、基因组DNA均一化及基于图像的细胞计数等。其中,值得注意的是,在细胞能量代谢检测过程中不建议使用任何基于细胞的代谢定量分析方法,比如MTT或ATP水平检测。
安捷伦针对贴壁细胞和悬浮细胞开发并优化了两种简单直接的归一化解决方案,以帮助研究者在使用Seahorse XF进行活细胞能量代谢检测时快速有效地进行标准化。
基于成像技术的能量代谢检测归一化流程
针对贴壁细胞的生长特性,安捷伦BioTek Cytation细胞成像多功能微孔板检测仪为Seahorse XF技术提供了一套自动化的细胞计数流程,方便用户快速开展XF数据归一化。经过优化的Seahorse XF Protocol包括几个重要步骤:在寡霉素/FCCP混合液中加入Hoechst 33342染料,以减少系统误差;使用BioTek Cytation 5及XF细胞成像和计数软件完成细胞计数,并在Wave软件中进行数据标准化;以及整合明场和荧光标记的细胞核图像,提高数据的可用性。
基于流式细胞术的能量代谢检测归一化流程
对于悬浮细胞体系,安捷伦的NovoCyte流式细胞仪具备独特的绝对计数功能,为Seahorse XF检测提供严谨的数据标准化方案。在该流程中,冻存的外周血T细胞被激活,然后通过流式细胞术进行标准化处理,显著降低了细胞接种带来的变异性。这有助于提升动态OCR测量的准确性,并能够更精确地评估细胞在不同代谢状态间的转换。
总之,安捷伦提供的Seahorse XF细胞能量代谢数据标准化流程,能高效校正外部因素造成的误差,提高数据的准确性和实验可重复性,有助于深入理解代谢机制,并支持疾病的诊断与治疗。高度的可比性和可靠性为大规模数据分析奠定基础。这两套方案分别适用于贴壁细胞和悬浮细胞体系,且经过多次验证,显示出极高的准确性。
采用人生就是博-尊龙凯时品牌的解决方案,研究者能够在中速和快速采集速率下获得准确的细胞计数数据,并通过低变异系数节省采集时间。这不仅提升了研究效率,也为未来的生物医学研究开辟了新的途径。